"Dan Ferro has taught some of the most
important singers of the 20th Century"
Brian Zeger - The Juilliard School
The Metropolitan Opera

"Intensive study of vocal technique as applied to the literature for active singers"

Les scientifiques «étonnés» de la propagation de la «superbactérie» typhoïde

“La typhoïde résistante aux antibiotiques se propage en Afrique et en Asie et constitue une menace majeure pour la santé mondiale”, rapporte BBC News.

La fièvre typhoïde est une infection bactérienne. Si elle n’est pas traitée, elle peut entraîner des complications potentiellement fatales, telles qu’un saignement interne.

Peu fréquent au Royaume-Uni (il y a eu 33 cas confirmés au Royaume-Uni au premier trimestre 2015 et on pense que la plupart d’entre eux ont été contractés à l’étranger), il est plus répandu dans les pays où l’assainissement et l’hygiène sont insuffisants.

Le titre est basé sur une étude qui a porté sur la génétique de la bactérie responsable de la fièvre typhoïde, Salmonella typhi, afin de retracer leurs origines.

L’étude a analysé les données génétiques de près de 2 000 échantillons de Salmonella typhi collectés entre 1903 et 2013. Elle recherchait une souche appelée H58, souvent résistante aux antibiotiques. Il a découvert que cette souche était probablement originaire d’Asie du Sud vers le début des années 1990 et s’est étendue à d’autres pays d’Afrique et d’Asie du Sud-Est. Il représentait environ 40% des échantillons collectés chaque année. Plus des deux tiers des échantillons H58 avaient des gènes qui leur permettraient d’être résistants aux antibiotiques.

Il serait complaisant de supposer que ce n’est qu’un problème pour les populations du monde en développement, car la résistance aux antibiotiques est une menace majeure pour la santé humaine dans le monde entier. Des études comme celles-ci aident les chercheurs à identifier et à suivre la propagation de ces bactéries. Cela peut les aider à utiliser plus efficacement les antibiotiques existants, en identifiant les types de résistance spécifiques qui sont courants.

D’où vient l’histoire?

L’étude a été réalisée par un grand nombre de chercheurs d’institutions internationales, y compris le Wellcome Trust Sanger Institute, au Royaume-Uni. Les chercheurs ont également été financés par un large éventail d’organisations internationales, y compris le Wellcome Trust et Novartis Vaccines Institute for Global Health.

L’étude a été publiée dans la revue à comité de lecture Nature Genetics.

Les sources d’information couvrent cette histoire raisonnablement. Certains rapports indiquent que c’est la souche H58 qui tue 200 000 personnes par an, mais cette étude n’a pas évalué cela.

Le chiffre de 200 000 semble être tiré des informations fournies par les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) des États-Unis, et est une estimation de tous les types de fièvre typhoïde, pas seulement la souche H58.

De quel type de recherche s’aggissait-t-il?

Il s’agissait d’une étude génétique portant sur les origines et la propagation de la souche H58 de Salmonella typhi – la bactérie responsable de la fièvre typhoïde. Cette souche est souvent considérée comme résistante aux antibiotiques.

Les bactéries typhoïdes se propagent par ingestion de matières fécales infectées provenant d’une personne atteinte de la maladie. Cela signifie que c’est un problème dans les pays où l’assainissement et l’hygiène sont insuffisants diabète de type 1. La fièvre typhoïde est rare au Royaume-Uni, et la plupart des cas dans ce pays sont des personnes qui se sont rendues dans des régions à haut risque où l’infection sévit encore, notamment le sous-continent indien, l’Asie du Sud et du Sud-Est et l’Afrique. Les chercheurs disent que 20 à 30 millions de cas de typhoïde sont estimés chaque année dans le monde.

La fièvre typhoïde a été traditionnellement traitée avec les antibiotiques chloramphénicol, ampicilline et triméthoprime-sulfaméthoxazole. Depuis les années 1970, des souches de typhoïde ont commencé à émerger et sont résistantes à ces antibiotiques (appelées souches multirésistantes). Différents antibiotiques, tels que les fluoroquinolones, ont été utilisés depuis les années 1990, mais des souches résistantes à ces antibiotiques ont été identifiées récemment en Asie et en Afrique. L’une de ces souches, H58, devient plus courante et a fait l’objet de cette étude.

Qu’est-ce que la recherche implique?

Les chercheurs ont utilisé des données de séquences génétiques provenant de 1 832 échantillons de bactéries Salmonella typhi collectées à travers le monde. Ils ont utilisé ces données pour évaluer quand la souche H58 (qui a des caractéristiques génétiques identifiables) est apparue et comment elle s’est propagée.

Ils ont d’abord identifié lequel des échantillons appartenait à la souche H58, et en quelle année il a été identifié pour la première fois. Ils ont également regardé quelle était la proportion d’échantillons recueillis chaque année de cette souche, pour voir si elle devenait plus commune.

Au fil du temps, l’ADN accumule des changements, et les chercheurs ont utilisé des programmes informatiques pour analyser les changements génétiques présents dans chaque échantillon afin d’identifier comment chaque souche est susceptible d’être liée aux autres. En combinant ces informations avec l’origine et l’année de chaque échantillon, les chercheurs ont développé une idée de la façon dont la souche s’était propagée.

Quels ont été les résultats de base?

Les chercheurs ont découvert que près de la moitié de leurs échantillons (47%) appartenaient à la souche H58. Le premier échantillon identifié dans cette souche provenait de Fidji en 1992 et a continué à être identifié jusqu’aux derniers échantillons, à partir de 2013. Des échantillons de souche H58 ont été identifiés dans 21 pays d’Asie, d’Afrique et d’Océanie, montrant qu’il est maintenant largement répandu. . Dans l’ensemble, 68% de ces échantillons de H58 présentaient des gènes qui leur permettraient d’être résistants aux antibiotiques.

Des échantillons très proches d’un point de vue génétique ont été trouvés dans différents pays, ce qui suggère qu’il y a eu un transfert humain de la bactérie entre ces pays. Leurs analyses génétiques ont suggéré que la souche était initialement située en Asie du Sud, puis s’est propagée en Asie du Sud-Est, en Asie occidentale et en Afrique de l’Est, ainsi qu’aux Fidji.

Il y avait des preuves de transferts multiples de la souche de l’Asie vers l’Afrique. La souche H58 représentait 63% des échantillons de l’Afrique orientale et australe. L’analyse suggère qu’il y a eu une vague récente de transmission de la souche H58 du Kenya à la Tanzanie, ainsi qu’au Malawi et à l’Afrique du Sud. Cela n’avait pas été rapporté auparavant, et les chercheurs l’ont décrit comme une «épidémie de typhoïde H58 en cours dans les pays d’Afrique orientale et australe».

La multirésistance aux médicaments était courante dans les échantillons H58 d’Asie du Sud-Est dans les années 1990 et, plus récemment, des échantillons de cette région ont acquis des mutations qui les ont rendus moins sensibles aux fluoroquinolones. Ceux-ci sont devenus plus courants dans la région, et les chercheurs ont suggéré que cela est dû à l’utilisation de fluoroquinolones pour traiter la fièvre typhoïde au cours de cette période, conduisant à ces souches résistantes ayant un avantage de survie.

En Asie du Sud, les taux de multirésistance aux médicaments sont plus faibles dans les échantillons récents qu’en Asie du Sud-Est. En Afrique, la plupart des échantillons présentaient une multirésistance aux antibiotiques plus anciens, mais pas aux fluoroquinolones, car celles-ci ne sont pas fréquemment utilisées.

Comment les chercheurs ont-ils interprété les résultats?

Les chercheurs disent que leur analyse est la première du genre pour la souche typhoïde H58, et que la propagation de cette souche “nécessite une attention internationale urgente”. Ils disent que leur étude «souligne la nécessité d’une surveillance de routine de longue date pour capturer les épidémies et surveiller les changements dans les populations bactériennes comme moyen de faciliter les mesures de santé publique, telles que l’utilisation d’antimicrobiens efficaces et l’introduction de programmes vaccinaux. morbidité et mortalité négligées causées par la typhoïde “.

Conclusion

Cette étude a fourni des informations sur la propagation d’une souche de typhoïde appelée H58, qui est communément résistante aux antibiotiques, en examinant la génétique des échantillons prélevés entre 1903 et 2013. Elle a montré que la souche était probablement apparue en Asie du Sud. puis se propager en Asie du Sud-Est et en Afrique. La souche présentait différents profils de résistance aux antibiotiques dans différentes régions – probablement influencés par des schémas différents dans l’utilisation des antibiotiques.

Bien que cette étude n’ait pas estimé le nombre de cas ou de décès dans le monde attribuables spécifiquement à cette souche, il y aurait 20 à 30 millions de cas de fièvre typhoïde dans le monde chaque année.

La propagation de la résistance aux antibiotiques est une menace majeure pour la santé humaine, et des études comme celle-ci peuvent nous aider à les surveiller et cibler le traitement plus efficacement.

En savoir plus sur la lutte contre la résistance antibactérienne et comment nous pouvons tous aider à faire notre part.