"Dan Ferro has taught some of the most
important singers of the 20th Century"
Brian Zeger - The Juilliard School
The Metropolitan Opera

"Intensive study of vocal technique as applied to the literature for active singers"

Éclosion de Streptococcus pneumoniae invasif de sérotype F dans une population marginale de la ville de Winnipeg, Canada, –

À Winnipeg (Canada), une éclosion de pneumocoque invasive du sérotype F a été signalée. L’analyse épidémiologique et microbiologique a révélé que, comparativement aux autres sérotypes, les personnes de sérotype F étaient plus susceptibles d’être sans abri et de s’adonner à la toxicomanie toxicité.

Contexte À Winnipeg (Canada), les taux de pneumopathie interstitielle invasive à pneumocoques ont doublé, avec une augmentation significative du nombre de cas dus au Streptococcus pneumoniae de sérotype F, qui représentaient très peu de cas chaque année. Méthodes Tous les cas de Électrophorèse en champ pulsé PFGE et multilocus en nombre variable analyse répétée en tandem MLVA ont été réalisés sur tous les isolats. Les profils PFGE et MLVA ont identifié plusieurs groupes possibles. Des interviews supplémentaires ont été menées pour obtenir des informations sur les facteurs de risque et les résultats. Le nombre de cas de PI dus au sérotype F a fortement augmenté d’environ – cas par an% des cas de PI dans – à% dans tous les isolats F appartenaient à une seule séquence de type ST, et ils étaient généralement sensibles à la pénicilline et aux fluoroquinolones mais pas à l’érythromycine par rapport aux cas causés par sérotypes F, les patients de sérotype F étaient plus susceptibles d’être sans domicile, résidant dans des quartiers défavorisés et s’adonnant à la toxicomanie, y compris l’usage intraveineux et le crack. Les sous-groupes identifiés par MLVA présentaient des taux encore plus élevés d’itinérance et de toxicomanie. A notre connaissance, il s’agit de la plus importante flambée communautaire de sérogroupe F de type IPD et le premier cas d’épidémie de sérotype F d’IPD chez un groupe marginalisé. population urbaine au Canada

épidémie, pneumococcie invasive, surveillance, sérotype F, sans-abri maladie pneumococcique invasive IPD a été principalement limitée aux cas sporadiques depuis le début de l’ère antibiotique Cependant, des éclosions ont eu lieu dans les milieux institutionnels et communautaires Streptococcus pneumoniae sérotype F a été identifié comme cause de plusieurs foyers dans ces deux contextes au cours des dernières décennies, malgré l’apparition d’antibiotiques efficaces et d’un vaccin polysaccharidique couvrant le sérotype F Ce sérotype serait hyperinvasif comparé à d’autres souches de DPI , et des rapports suggèrent qu’il pourrait En Colombie-Britannique, la province canadienne du Manitoba a mis en place un programme de vaccination antipneumococcique polysaccharidique financé par des fonds publics pour les personnes à risque élevé en raison des comorbidités et des personnes âgées de ≥ ans. Un vaccin conjugué antipneumococcique heptavalent a été ajouté au public. programme de vaccination de routine financé dans d’autres La mise en œuvre de tels programmes a entraîné une baisse importante des taux de MPI chez les enfants et les adultes Cependant, la capitale du Manitoba, la population de Winnipeg a presque doublé les taux de MPI, avec une augmentation significative du nombre de cas dus au sérotype. Dans ce rapport, nous décrivons les résultats des enquêtes de laboratoire et épidémiologiques sur ce qui, à notre connaissance, est la plus importante éclosion communautaire de sérotype F IPD documentée.

Méthodes

Définition de cas et surveillance

Un cas de PI a été défini comme l’isolement de S pneumoniae à partir d’un site normalement stérile incluant du sang ou du liquide céphalorachidien, synovial ou péritonéal et du tissu osseux, mais pas des yeux, de l’oreille moyenne ou des liquides pleuraux. La définition de cas d’IPD avec épidémie entre septembre et janvier a été incluse dans cette analyse. L’épidate a été définie comme étant la date de début des symptômes, la date de prélèvement, la date du diagnostic et la date de déclaration à la santé publique. Les responsables de la santé, qui transmettent ensuite les cas aux autorités sanitaires régionales pour enquête et gestion, étudient les cas d’IPD par des infirmières de santé publique en utilisant un court formulaire pour recueillir des informations démographiques, cliniques et sur les facteurs de risque, qui sont ensuite saisies dans la base de données électronique. Programme régional de santé publique Les données utilisées dans cette enquête proviennent de cette base de données. De plus, nous avons obtenu des informations sur les Les isolats de S pneumoniae prélevés chez des patients IPD au Manitoba sont transmis au Laboratoire provincial de Cadham, le laboratoire provincial de vaccination, qui est un registre provincial électronique des antécédents de vaccination établi à l’échelle de la province, quel que soit le lieu de résidence. Le sérotypage est effectué par la réaction de Quellung au moyen d’un antisérum commercial, d’un groupe, d’un type et d’un facteur commercial SSI Diagnostica, Statens Serum Institut, Copenhague, Danemark Pour le laboratoire de santé publique du Manitoba, puis le laboratoire national de microbiologie de Winnipeg. but de cette analyse, un cas hospitalisé était défini comme une personne admise pendant au moins heures; Le statut socioéconomique a été mesuré à l’aide du score SEFI de l’indice des facteurs socioéconomiques, un score factoriel régional dérivé des données du recensement canadien qui reflète les déterminants sociaux non médicaux de la santé, y compris la fréquentation scolaire, la participation au marché du travail et Niveaux d’emploi Les cas avec un score SEFI moins favorable ont été définis comme ceux avec des scores SEFI dans les quintiles inférieurs. Toute indication de vaccin a été définie comme une maladie pour laquelle la vaccination antipneumococcique est recommandée comme spécifié dans le Guide canadien d’immunisation.

Typage moléculaire des isolats de S pneumoniae

Electrophorèse en champ pulsé PFGE, typage multilocus MLST, et MLVA en multilocus à nombre variable d’analyses de répétitions en tandem ont été réalisés sur tous les isolats F de cas diagnostiqués entre janvier et janvier. La procédure PFGE a été réalisée selon Louie et al. la méthode de Enright et Spratt Génotypage MLVA à base de réaction en chaîne polymérase a été réalisée et analysée selon le schéma de Rakov et al et Koeck et al En outre, les tests de sensibilité aux antibiotiques ont été menées conformément aux directives Laboratory Standards Institute Sur la base des résultats PFGE et MLVA, plusieurs clusters possibles ont été identifiés, et tous les cas identifiés dans les clusters n = ont été étudiés. Des entretiens en face à face ont été menés pour vérifier les données existantes et obtenir des informations complémentaires. sur les facteurs de risque et les résultats, y compris l’origine ethnique, l’itinérance, l’état de santé préexistant s, et le tabagisme et la toxicomanie Les patients ont été localisés et interviewés par des infirmières de santé publique locales. Pour ceux qui étaient décédés n = ou ne pouvaient pas être localisés n =, les dossiers médicaux et de santé publique ont été utilisés

Analyses statistiques

Nous avons réalisé une analyse descriptive comparative des facteurs sociodémographiques et cliniques ainsi que du statut vaccinal des cas F et non-F. Des analyses similaires ont été menées pour comparer les facteurs de risque et les résultats des clusters identifiés par MLVA. Toutes les analyses ont été réalisées avec le logiciel Stata, version StataCorp , College Station, Texas

RÉSULTATS

Les indices sont des rapports de risque qui comparent le risque de chaque issue clinique parmi les cas F avec ceux parmi les cas non FFigure View largeTélécharger diapositiveCompte mensuel des cas de pneumococcie invasive par sérotype et mois et année de diagnostic, parmi les résidents de Winnipeg, janvier à décembre. Date de début des symptômes, date de collecte des échantillons, date du diagnostic et date signalée à la santé publiqueFigure Voir grandTableau de téléchargementCompte mensuel des cas de pneumococcie invasive par sérotype et mois et année de diagnostic, parmi les résidents de Winnipeg, janvier à décembre. de la date de début des symptômes, de la date de collecte des échantillons, de la date du diagnostic et de la date de notification à la santé publiqueLe nombre de cas de PI dus au sérotype F a fortement augmenté par rapport aux autres sérotypes, cas F étaient plus susceptibles d’être des adultes entre l’âge et l’odds ratio [OR], [% intervalle de confiance {CI}, -] et Les patients de sérotype F étaient plus susceptibles de déclarer l’itinérance OU, [% IC, -] ou la toxicomanie OU, [% IC, -] et étaient moins susceptibles de déclarer une maladie chronique préexistante OU, [% CI, -] Parmi les cas de sérotype F signalés entre septembre et janvier,% d’isolats étaient sensibles à la pénicilline,% étaient sensibles à la lévofloxacine et seulement% étaient sensibles au typage érythromycineMLST déterminé que tous les isolats F appartenaient à à un seul type de séquence, profil de l’allèle ST MLST: aroe, gdh, gki, recp, spi, xpt et ddl Lorsque MLVA a été menée, F isole les clusters formés, avec cluster cluster représentant% n = des cas Tableau Bien que non épidémiologique évident des liens ont été trouvés entre les cas dans ce groupe, comparés à d’autres cas F, ces patients étaient plus susceptibles d’être des hommes% et d’être des adultes plus jeunes âgés de – ans% En outre, les patients de ce groupe étaient plus susceptibles de rapporter h % d’absentéisme, abus d’alcool%, et abus de substances% Tableau Ce groupe comprenait également un sous-groupe de cas avec un profil MLVA identique Ces patients présentaient des proportions encore plus élevées d’itinérance n =, abus d’alcool n =, et abus de substances n =; La plupart étaient d’ethnie autochtone n = et sans emploi n = et déclaraient vivre dans un refuge, un logement de groupe ou un hôtel Deux de ces patients avaient le virus de l’immunodéficience humaine / SIDA Dans cette sous-série, les cas d’hépatite C présentaient des taux d’immunisation très faibles, même comparativement à d’autres cas de PI à Winnipeg, et seuls les isolats de la sous-famille étaient sensibles à la pénicilline et à la lévofloxacine, tout en étant résistants à l’érythromycine. Des cas épidémiologiques évidents, par exemple, le partage du même espace n’a pas pu être identifié entre ces cas Tableau Maladies pneumococciques invasives causées par le sérotype F par groupe de variables variables Multilocus Groupe d’analyse répétée en tandem, caractéristiques démographiques et cliniques et facteurs de risque, parmi les résidents de Winnipeg, septembre à Janvier Groupement des grappes caractéristiques Autres sous-grappes totales A n = Autre n = Total n = N = n = n = âge, y & lt; – ≥ Sexe masculin Lieu de résidence Autres parties de la ville Zone de centre-ville Zone défavorisée Scénario SEFI moins favorable Homeless Réside dans une PCH / établissement de soins chroniques ou fréquente la garderie Abus d’alcool Tabagisme Abus de substances Toute indication de vaccin Reçu PCV ou PPSV Clinical Résultats Septicémie hospitalisée Méningite décédée Résistance aux antibiotiques Pénicilline Érythromycine Lévofloxacine Groupe caractéristique des grappes Autre Sous-groupe total A n = Autre n = Total n = n = n = n = Âge, y & lt; – ≥ Sexe masculin Lieu de résidence Autres parties de la ville Zone de centre-ville Zone défavorisée Scénario SEFI moins favorable Homeless Réside dans une PCH / établissement de soins chroniques ou fréquente la garderie Abus d’alcool Tabagisme Abus de substances Toute indication de vaccin Reçu PCV ou PPSV Clinical Résultats Hospitalisation Septicémie Méningite Décès Résistance aux antibiotiques Pénicilline Érythromycine Lévofloxacine Les données sont présentées sous forme de% Abréviations: PCH, foyer de soins personnels; PCV, vaccin antipneumococcique conjugué; PPSV, vaccin antipneumococcique polysaccharidique; SEFI, Index des facteurs socio-économiques Les cas avec un score SEFI moins favorable ont été définis comme ceux avec des scores SEFI dans les quintiles inférieurs

DISCUSSION

Les souches F ul sont un problème de santé publique majeur, car le sérotype F n’est inclus dans aucun vaccin conjugué La résistance aux macrolides chez S pneumoniae au Canada a été bien documentée . Cependant, le sérotype F est rarement résistant aux antibiotiques. À notre connaissance, c’est la première fois que la résistance aux macrolides généralisée parmi les souches d’épidémies de F a été rapportée. Il est possible que la résistance aux macrolides ait pu conférer cette résistance aux macrolides. épidémie souche un avantage de survie par rapport à d’autres souches Bien que des niveaux élevés de résistance à la pénicilline et aux fluoroquinolones aient été documentés au Canada, les organismes de cette éclosion n’étaient pas résistants à ces dernières classes d’antibiotiques. Dans les cas signalés, nos analyses ont constamment mis en évidence des facteurs de risque interconnectés qui auraient pu être Un logement sûr, y compris le sans-abrisme, le surpeuplement et l’utilisation de refuges pour sans-abri, a été impliqué dans des éclosions de PI des sérotypes F et F non-F [ ,,] Le surpeuplement n’a pas été évalué dans l’éclosion de Winnipeg; Cependant, l’utilisation de refuges pour sans-abri et d’autres formes de logement précaire a peut-être joué un rôle dans la genèse de l’éclosion en facilitant une exposition rapprochée entre les cas et les contacts. Malheureusement, repérer un endroit commun, tel qu’un refuge pour sans-abri particulier, n’était pas possible en raison d’un mauvais rappel et des transitions fréquentes d’un lieu de résidence à un autre. Une des premières éclosions documentées de sérotype F était dans une prison du Texas. Les chercheurs ont découvert que l’utilisation de drogues intraveineuses était fortement associée aux IPD, ce qui correspond à l’expérience de Winnipeg avec% des cas dans un sous-groupe autodéclaration de consommation intraveineuse de drogues. La consommation de crack a déjà été associée à une éclosion de sérotype à Vancouver, Canada , et l’utilisation autodéclarée de crack était répandue dans un sous-groupe de l’éclosion de Winnipeg. L’usage abusif de la cocaïne conduit à une PI n’est pas claire Un adultérin commun de la cocaïne de rue connu sous le nom de lévamisole a été détecté de plus en plus au Canada Parce que le lévamisole est connu pour provoquer une agranulocytose -B allèle comme la communauté des Premières Nations touchée par cette éclosion, une enquête plus poussée sur le lien entre les cas de PI à Winnipeg et l’utilisation de crack est justifiée. Les cas ont été regroupés géographiquement dans des zones communautaires adjacentes à Winnipeg. Les drogues illicites à Winnipeg ont révélé qu’un fort pourcentage fréquentait plusieurs zones géographiques distinctes de la ville Plusieurs de ces endroits correspondent aux communautés dans lesquelles cette épidémie a été découverte. Ces communautés contiennent plusieurs refuges pour sans-abri, maisons de chambres, hôtels et services de proximité. ceux qui sont sans abri ou qui consomment des drogues illicites, ce qui peut expliquer en partie le regroupement d’environ% des patients le sérotype F dans cette épidémie n’avait jamais reçu le vaccin PPSV Une campagne de vaccination utilisant le PPSV protégeant contre le sérotype F a été menée ciblant les individus à risque. Des lettres ont été envoyées aux cliniciens pour les informer de l’épidémie et recommander la vaccination des personnes non vaccinées. utiliser des drogues illicites En outre, un total de cliniques de sensibilisation ont été menées avec & gt; doses de PPSV administrées par la santé publique en février Au cours des mois suivants, le nombre de cas de MPI attribuables au sérotype F a diminué, bien que le volume global de DPI demeure élevé. Une surveillance accrue continue a été mise en place pour caractériser davantage les cas futurs de DPI au Manitoba. La plupart des données sur le nombre de cas provenaient de la surveillance passive de routine et non de la recherche active de cas. Bien que la plupart des informations aient été recueillies au moment de l’épidémie, d’autres informations ont été recueillies rétrospectivement Cette épidémie souligne l’importance d’un suivi continu de l’incidence des IPD et de la distribution du sérotype S pneumoniae suite à l’introduction de plusieurs vaccins antipneumococciques conjugués efficaces dans les programmes de vaccination systématique des enfants. ins peuvent donner un aperçu de leur virulence et de leurs liens avec des souches F impliquées dans des flambées de F précédentes aux États-Unis et au Canada, et des études de portage rhinopharyngé parmi les populations à haut risque peuvent fournir des indices sur l’origine de cette épidémie

Remarques

Contributions des auteurs E S a eu un accès complet à toutes les données de l’étude et assume la responsabilité de l’intégrité des données et de l’exactitude de l’analyse des données E S a analysé les données; E S, M I et S M M ont rédigé le manuscrit; G P et X D ont effectué le typage moléculaire et les tests de sensibilité des isolats F; D R P, J L W et P V C enquêtes de laboratoire supervisées et coordonnées; et SMM ont supervisé l’analyse épidémiologique et coordonné l’enquête Tous les auteurs ont contribué à la conception et la conception de l’étude et à l’interprétation des données Tous les auteurs ont revu le manuscrit pour contenu intellectuel et approuvé le projet final pour soumissionDisclaimer L’interprétation et les conclusions Le SMM a été financé par une subvention du Conseil de recherches en santé du Manitoba. SMM est une chaire de recherche du Canada en pharmacoépidémiologie et en évaluation des vaccins. La Great-West, la London Life et un jeune chercheur canadien de la Société canadienne du cancer, numéro de subvention – Conflits d’intérêts potentiels SMM a reçu une subvention sans restriction de GSK, Pfizer et Sanofi Pasteur pour des études non reliées Tous les autres auteurs ne signalent aucun conflit potentielTous les auteurs s ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits potentiels de conflits d’intérêts que les éditeurs jugent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués